น้ำมันหอมระเหยจะระเหยอย่างรวดเร็วเมื่อสัมผัสกับอากาศ และคุณภาพจะลดลงได้ง่ายเมื่อสัมผัสกับแสง อุณหภูมิที่สูงเกินไป-ไม่ว่าจะสูงหรือต่ำเกินไป-รวมถึงการสัมผัสกับอากาศล้วนเป็นอันตรายต่อการเก็บรักษา โดยทั่วไปน้ำมันหอมระเหยจะบรรจุในขวดแก้วสุญญากาศสีเข้ม ตามหลักการแล้ว ไม่ควรเก็บไว้ในขวดที่มีหยอดยาง เนื่องจากน้ำมันหอมระเหยบางชนิดสามารถกัดกร่อนยางได้ ยกเว้นมะกรูด น้ำมันหอมระเหยจากซิตรัสมักจะสลายตัวและเหม็นหืนภายในระยะเวลาอันสั้น หากคุณตรวจพบกลิ่นที่ผิดปกติ เปรี้ยว หรือมีกลิ่น- แสดงว่าน้ำมันไม่เหมาะกับการใช้งานอีกต่อไป ในทางกลับกัน คุณภาพของน้ำมันหอมระเหยบางชนิดจะดีขึ้นตามอายุ- ซึ่งเป็นปรากฏการณ์ที่มักพบในน้ำมันที่ได้มาจากรากและไม้
น้ำมันหอมระเหยควรเก็บไว้ในที่เย็นและมีอุณหภูมิห้องค่อนข้างคงที่- โดยทั่วไปไม่แนะนำให้เก็บไว้ในตู้เย็น เนื่องจากความผันผวนของอุณหภูมิที่มีนัยสำคัญอาจส่งผลเสียต่อคุณภาพได้ น้ำมันหอมระเหยบริสุทธิ์ไวต่อแสงและเสี่ยงต่อการเกิดออกซิเดชัน ดังนั้น นอกจากเก็บไว้ในขวดสีเข้ม-แล้ว ควรเก็บไว้ในที่มืดที่อุณหภูมิคงที่ประมาณ 30 องศาหรือต่ำกว่า อย่างไรก็ตาม น้ำมันตัวพา (น้ำมันพืช) เหมาะสำหรับแช่เย็น การกินน้ำมันหอมระเหยโดยไม่ได้ตั้งใจอาจทำให้เกิดผลข้างเคียงและอาจมีความเสี่ยงต่อสุขภาพที่ร้ายแรง ต้องเก็บให้พ้นมือเด็กอย่างเคร่งครัด
เมื่อเปิดแล้ว ควรใช้น้ำมันหอมระเหยด้วยความระมัดระวังหลังการใช้แต่ละครั้ง: ตรวจสอบให้แน่ใจว่าปิดฝาแน่นแล้ว และเช็ดคราบน้ำมันที่อาจซึมลงบนคอขวดออกเพื่อป้องกันการเกิดออกซิเดชัน
น้ำมันหอมระเหยบริสุทธิ์ 100%-เช่น ไม้จันทน์ กำยาน แพทชูลี่ และหญ้าแฝก- โดยทั่วไปสามารถเก็บไว้ได้นานหลายปี เช่นเดียวกับไวน์ชั้นดี พวกมันอาจจะกลมกล่อมและดีขึ้นตามอายุ อย่างไรก็ตาม เราต้องระมัดระวังเกี่ยวกับความเสี่ยงของการเกิดออกซิเดชัน เนื่องจากการสัมผัสกับอากาศ (โดยการเปิดฝาทิ้งไว้) อาจทำให้น้ำมันเสื่อมสภาพได้ง่าย ในทางกลับกัน น้ำมันหอมระเหยบางชนิดมีอายุการเก็บรักษาไม่นาน ตัวอย่างเช่น น้ำมันซิตรัสส่วนใหญ่ (ยกเว้นมะกรูด) มีอายุการเก็บรักษาเพียงสองปี
น้ำมันหอมระเหยที่เจือจางด้วยน้ำมันตัวพา (น้ำมันพื้นฐาน) จะมีอายุการเก็บรักษาสั้นกว่ามาก-โดยทั่วไปคือประมาณสามเดือน-แม้ว่ากรอบเวลานี้จะแตกต่างกันไปก็ตาม อย่างไรก็ตาม ขอแนะนำอย่างยิ่งให้บริโภคส่วนผสมดังกล่าวโดยเร็วที่สุด ดังนั้นเมื่อซื้อน้ำมันหอมระเหยประเภทนี้ จึงจำเป็นอย่างยิ่งที่จะต้องใส่ใจกับวันหมดอายุที่เฉพาะเจาะจงอย่างใกล้ชิด
